Если хотите работать "каменщиком" и собирать функционал по кирпичику, то выбирайте Axapta, а если заинтересованы в приобретении прикладного опыта(не путать с опытом программирования), то лучше выбрать Navision. А насчёт большей востребованности специалистов по Axapta я бы поспорил.... И
www.job.ru действительно не показатель. В одной компании, занимаясь Axapta вам могут платить 1200, а в другой, занимаясь Navision вам могут платить от 2000. А может и наоборот.
Всё зависит от места и времени. Вот и думайте.