Нашёл решение!
Скачал отсюда
Navision 4.0 SP2 Critical Update файлы не совпадавшие с нашими и переписал их в директорию Navision Client и в директорию Navision Developers Toolkit.
Создал базу заново и все заиграло!
captain, ещё раз спасибо за подсказку - библиотеки действительно надо было синхронизировать.