В текстовом редакторе Far можно выделять колонки текста, а в нотепаде - нет. Поиск/замена позволяет искать и заменять непечатные символы (Enter, Tab, etc). В последнее время только для этого пользуюсь Фаром. Файлы уже привык в експлорере с места на место перекидывать.
Еще там хорошо получается сравнить два каталога с кучей файлов. Например, два разных приложения для 2009-й Аксапты. Но, уже давно не приходилось этим пользоваться.

А! еще просмотр файлов в 16-ричном виде.