Цитата:
Возможно ли в Аксапте в качестве аналитики использовать справочник, например по сч.62 справочник Клиентов? Или это возможно настроить только субсчетами?
Можно-то можно, НО:
1. Эта настройка будет работать для ВСЕХ счетов? А нужна ли Вам такая аналитика, например, на 70 счете?

Хотя, в принципе, это нестрашно.
2. Эту связь можно всегда восстановить по ссылкам, как уже mazzy рассказывал, не вводя новой аналитики. И зачем тогда лишняя аналитика?
Цитата:
Поставщиков - однозначно не стоит. Клиентов - можно, но только в агрегированном виде, например, в виде регионов сбыта (под бюджетирование).
Не совсем согласен. Можно использовать регионы у клиентов для отчетов. А вот для бюджетирования, увы, придется, наверное, аналитику использовать. Хотя, может, я и неправ.
Цитата:
Договора - зависит от их количества. Если договоров 10000 и месяц - то нет.
Пожалуй, да. Обидно, правда, что такой сущности, как договор, в Аксапте не предусмотрено. Есть контракт, но это - далеко не договор.