Одна номенклатура на разных счетах.

[Raven Melancholic]

Доработка конечно дело хорошее (тем более не особо сложная), но, судя по сообщению в теме (по крайней мере по используемым счетам) у них производится номенклатура на продажу, а закупается для использования в деятельности компании. Поэтому проблемы могут быть не только в разноске, но и в правилах учетной политики (например, ГП учитываем по средней, а материалы по ФИФО; ГП учитывается по партиям, а материалы нет и т.п.).
Вобщем для советов мало информации.