1. Остановить АОС.
2. Забекапить базу.
3. Забекапить старый слой.
4. Перенести слой.
5. Удалить индексы.
6. Запустить двухзвенку.
7. Сделать синхронизацю.
8. Если ошибок нет, можно запускать АОС и работать, если есть - разбираться.
В некоторых случаях необходимо вместо п.7 сделать глобальную компиляцию. Я рекомендую в любом случае так делать.