Опциональное использование комплектации при отгрузке

[gene]

Постановка вопроса не очень понятна. Если речь о том, что для одной и той же номенклатуры (или разных номенклатур с одной и той же группой складских моделей) использовать или не использовать функциональность складских отгрузок в зависимости от определенных условий, то это управляется на трех уровнях: в местонахождении номенклатуры (InventItemLocation), в складе, в группе складских моделей. Посмотрите, например, метод SalesLine.useWMSOrder().
Или вы хотите чего-то другого?
Для расчета размера отгрузки по-любому придется что-то допиливать. Какой-то объем есть в маршрутах комплектации, но все равно нужно смотреть подробнее.
Сама функциональность складских отгрузок (если без адресного склада), насколько я понимаю, входит в стандартный пакет и не требует отдельного модуля Управления складом.